Jabatan Surgeri ditubuhkan pada tahun 1998 apabila kumpulan pertama penuntut perubatan universiti ini memasuki fasa klinikal. Jabatan ini terletak di Tingkat 4, blok B, Fakulti Perubatan dan Sains Kesihatan. Jabatan ini menumpukan perhatian dalam penyelidikan, pengajaran dan juga perkhidmatan klinikal kepada pelajar prasiswazah serta pascasiswazah. Jabatan Surgeri menyediakan perkhidmatan klinikal di Hospital Sultan Abdul Aziz Shah, UPM. Antara perkhidmatan yang disediakan: